Les causes d'apparition et de développement des épidémies sont multiples :
- Les phénomènes climatiques et catastrophes naturelles, comme la sécheresse, la saison des pluies, les tremblements de terre ou les inondations, favorisent la propagation des virus à cause de leurs dégâts environnementaux.
- Les conflits armés engendrent la destruction ou la dégradation des infrastructures de santé, la perturbation des programmes de prévention des maladies et l'affaiblissement des systèmes de surveillance, ce qui augmente le risque d'une épidémie grave.
- L'explosion démographique peut provoquer également des poussées, notamment de choléra, dues à une insuffisance de l'hygiène, au manque d'eau potable et la promiscuité dans laquelle vivent les populations.