De symptomen van difterie verschijnen meestal 2 tot 5 dagen na blootstelling aan de bacterie. Veelvoorkomende symptomen zijn koorts, keelpijn en gezwollen lymfeklieren in de hals.
Twee tot drie dagen na de infectie heeft de toxine het gezonde weefsel in de luchtwegen vernietigd. Dood weefsel hoopt zich dan op in de luchtwegen, wat leidt tot de vorming van een dikke grijzig-witte membraan. Die kan de neus, amandelen en keel bedekken, waardoor ademhalen en slikken moeilijk wordt.
Er kunnen complicaties optreden, zoals ontsteking van het hart of de zenuwen.